协会内设综合管理部、政策研究部、实践实训部、理论培训部、校友联络部、宣传媒体部、拓展培训部、信息技术部8个职能部门，并在此基础上形成目标导向、部门协同、特色鲜明、矩阵灵活的凝聚-招录事业群、开放-拓展事业群和卓越-培养事业群3个事业群，由协会会长团统筹管理。